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| 順位 | 会社 | 時価総額 | PER | PBR | 期末 | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 中外製薬株式会社 | 13兆8,425億円 | 31.3 | 6.70 | 2025/12 | |
| 2 | 武田薬品工業株式会社 | 9兆113億円 | 45.2 | 2.38 | 2026/03 | |
| 3 | 第一三共株式会社 | 5兆2,410億円 | 19.7 | 3.03 | 2026/03 | |
| 4 | 大塚ホールディングス株式会社 | 4兆8,357億円 | 13.0 | 1.55 | 2025/12 | |
| 5 | アステラス製薬株式会社 | 4兆5,657億円 | 15.5 | 2.47 | 2026/03 | |
| 6 | 塩野義製薬株式会社 | 3兆888億円 | 14.4 | 1.75 | 2026/03 | |
| 7 | エーザイ株式会社 | 1兆4,205億円 | 35.6 | 1.53 | 2026/03 | |
| 8 | 協和キリン株式会社 | 1兆3,262億円 | 19.7 | 1.48 | 2025/12 | |
| 9 | 小野薬品工業株式会社 | 1兆2,515億円 | 16.9 | 1.39 | 2026/03 | |
| 10 | 住友ファーマ株式会社 | 8,241億円 | 7.7 | 2.81 | 2026/03 | |
| 11 | 参天製薬株式会社 | 5,770億円 | 15.7 | 1.94 | 2026/03 | |
| 12 | ロート製薬株式会社 | 5,691億円 | 15.9 | 1.81 | 2026/03 | |
| 13 | 大正製薬ホールディングス株式会社 | 4,700億円 | 23.8 | 0.58 | 2023/03 | |
| 14 | 久光製薬株式会社 | 3,600億円 | 14.3 | 1.12 | 2025/02 | |
| 15 | 日本新薬株式会社 | 3,594億円 | 11.6 | 1.18 | 2026/03 | |
| 16 | 株式会社ツムラ | 2,877億円 | 10.0 | 0.87 | 2026/03 | |
| 17 | サワイグループホールディングス株式会社 | 2,558億円 | 24.5 | 1.43 | 2026/03 | |
| 18 | キッセイ薬品工業株式会社 | 2,160億円 | 14.0 | 0.84 | 2026/03 | |
| 19 | 東和薬品株式会社 | 2,063億円 | 37.5 | 1.11 | 2026/03 | |
| 20 | 科研製薬株式会社 | 1,828億円 | 73.2 | 1.06 | 2026/03 | |
| 21 | 持田製薬株式会社 | 1,258億円 | 15.5 | 0.87 | 2026/03 | |
| 22 | ゼリア新薬工業株式会社 | 1,096億円 | 11.4 | 0.89 | 2026/03 | |
| 23 | 栄研化学株式会社 | 1,057億円 | 27.2 | 2.30 | 2026/03 | |
| 24 | 杏林製薬株式会社 | 986億円 | 27.4 | 0.66 | 2026/03 | |
| 25 | JCRファーマ株式会社 | 737億円 | 31.8 | 1.48 | 2026/03 | |
| 26 | あすか製薬ホールディングス株式会社 | 679億円 | 12.3 | 0.95 | 2026/03 | |
| 27 | 株式会社タウンズ | 504億円 | 9.0 | 2.59 | 2026/06 | |
| 28 | Heartseed株式会社 | 421億円 | 218.1 | 5.85 | 2025/12 | |
| 29 | 生化学工業株式会社 | 414億円 | 27.0 | 0.53 | 2026/03 | |
| 30 | 富士製薬工業株式会社 | 385億円 | 12.6 | 0.81 | 2025/09 | |
| 31 | ダイト株式会社 | 347億円 | 11.2 | 0.65 | 2026/05 | |
| 32 | 株式会社ミズホメディー | 325億円 | 9.5 | 1.74 | 2025/12 | |
| 33 | コーア商事ホールディングス株式会社 | 319億円 | 8.5 | 1.02 | 2026/06 | |
| 34 | ラクオリア創薬株式会社 | 247億円 | 87.6 | 3.61 | 2025/12 | |
| 35 | 扶桑薬品工業株式会社 | 223億円 | 10.0 | 0.57 | 2026/03 | |
| 36 | 大幸薬品株式会社 | 151億円 | 16.2 | 1.76 | 2025/12 | |
| 37 | 株式会社免疫生物研究所 | 125億円 | 38.0 | 6.78 | 2026/03 | |
| 38 | わかもと製薬株式会社 | 122億円 | 53.6 | 1.01 | 2026/03 | |
| 39 | キッズウェル・バイオ株式会社 | 121億円 | 41.2 | 4.18 | 2026/03 | |
| 40 | 森下仁丹株式会社 | 92億円 | 14.5 | 0.70 | 2026/03 | |
| 41 | 有機合成薬品工業株式会社 | 86億円 | 26.9 | 0.62 | 2026/03 | |
| 42 | 株式会社ステムセル研究所 | 78億円 | 49.6 | 2.88 | 2026/03 | |
| 43 | 日本ケミファ株式会社 | 76億円 | 32.5 | 0.33 | 2026/03 | |
| 44 | コージンバイオ株式会社 | 62億円 | 24.6 | 1.04 | 2026/03 | |
| 45 | 室町ケミカル株式会社 | 42億円 | 25.2 | 1.60 | 2026/05 | |
| 46 | 株式会社中京医薬品 | 24億円 | 25.8 | 0.84 | 2026/03 |